معلومة

5.3.1: الوحدة الأولى - التخصيص - تقرير معمل هندسة الحمض النووي الريبي - علم الأحياء

5.3.1: الوحدة الأولى - التخصيص - تقرير معمل هندسة الحمض النووي الريبي - علم الأحياء


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

ملخص

ستكون المهمة النهائية للوحدة 1 عبارة عن تقرير مختبري تصف فيه تحقيق هندسة RNA الخاص بك. من الضروري ألا تتصل فقط ماذا او ما فعلت ولكن لماذا فعلت ذلك ، وليس فقط ما هي بياناتك في الوقت الحاضر عروض لكن ما هذا يعني للمستقبل. وبالتالي ، يمكنك أن تفترض الفهم السريع - ولكن ليس بداهة المعرفة - بالمعلومات التقنية ، وبالتالي يجب أن تسعى جاهدة لتقديم عملك بطريقة منطقية خطوة بخطوة.

تأكد من مراجعة 20.109 بيان حول التعاون والنزاهة.

الخدمات اللوجستية

تقديم المسودة الأولى

من المقرر تقديم المسودة الأولى لمقالك البحثي بحلول الساعة 11 صباحًا في اليوم الأول من الوحدة الثانية.

تقديم المادة المنقحة

سيتم إرجاع مسودتك الأولى ، مع تعليقات من كل من هيئة التدريس الفنية والكتابية ، في اليوم 4 من الوحدة التدريبية 2 (بعد 9 أيام). ستتاح لك بعد ذلك الفرصة لمراجعة تقريرك لتحسين درجة حرف واحد وثالث. بمعنى آخر ، يمكن مراجعة C حتى B + ، و C + إلى A- ، و B- إلى A ، وما إلى ذلك) المسودة النهائية مستحقة بعد أسبوع واحد ، في اليوم 6 من الوحدة 4. يرجى تحديد أي مراجعات جوهرية على النص الخاص بك ، على سبيل المثال ، باستخدام خط ملون مختلف.

توقعات التنسيق

  • يجب أن يكون المستند الرئيسي (باستثناء الأرقام) / يكون
    • .doc (مفضل) أو .pdf
    • خط 12 نقطة
    • بهوامش 1 بوصة
    • تباعد مزدوج (باستثناء الملخص)
  • يمكن عمل الأرقام في برنامج رسم منفصل (مثل PowerPoint) ، ويجب إرسالها بتنسيق pdf

إرشادات حول الطول

بدون احتساب الأرقام ، يجب أن يكون طول التقرير حوالي 10-13 صفحة ، وبالتأكيد لا يتجاوز 15 صفحة.

على الرغم من أنها متغيرة إلى حد ما ، إلا أن أطوال الأقسام النموذجية قد تكون:

  • مقدمة: 2-3 صفحات
  • الأساليب: ~ 3 صفحات
  • النتائج: 3-4 صفحات
  • مناقشة: 3-4 صفحات

إرشادات المحتوى

ابدأ بقراءة العام مبادئ توجيهية لكتابة البحث الخاص بك، التي تصف التوقعات لكل قسم من التقرير ، من الملخص إلى المراجع. فيما يلي بعض الملاحظات الخاصة بالوحدة رقم 1.

مقدمة

نرحب بك لاستخدام إبداعك وحكمك على الشكل الذي يجب أن تبدو عليه المقدمة الجيدة ؛ ومع ذلك ، قد تجد الهيكل المقترح (انظر أيضًا الإرشادات العامة) والمحتوى أدناه مفيدًا. أحد الأساليب التي قد تختارها هو التأكيد على تحسين الطريقة لتحفيز المقدمة ، ومعالجة الأسئلة الإرشادية التالية:

  • الفقرة 1
    • ما هو سيليكس؟
    • ما هي بعض المعايير (في تفكيرك الخاص) التي إذا تم تحقيقها ، ستزيد من كفاءة وإمكانية الوصول إلى SELEX.
    • ما هي بعض المعايير الرئيسية لتحسينها في تحقيق الكفاءة التي تريدها؟
  • الفقرة 2
    • ما هي المعلمات التي اخترت التحقيق فيها في دراستك الحالية؟
    • ما هو الأساس المنطقي لاختيار استكشاف هذه المعلمة في سياق تحسين كفاءة الاختيار؟ (بمعنى ، كيف ترتبط هذه المعلمة بكفاءة الاختيار؟)
  • الفقرة 3
    • لماذا اخترت ظروفك الخاصة؟ [ضع هذا في الاعتبار في سياق مساحة المعلمة المغطاة كقسم معمل ، بالإضافة إلى ما تفعله بشكل فردي]
    • ستختلف توقعاتك حول كيفية النتيجة كدالة لمساحة المعلمة التي تم استكشافها.
    • ملخص موجز للطريقة التي تنوي بها تقييم ما إذا كانت تجربتك قد نجحت (تجربتك بشكل فردي ، وتم تجميعها عبر قسم المختبر الخاص بك).
    • لمحة موجزة عن نتائجك واستنتاجاتك.

الأرقام المقترحة

من المتوقع أن يحتوي تقريرك على أكثر أو أقل من الأرقام التالية. بالطبع أنت مدعو لإجراء تعديلات وإضافات على النحو الذي تراه مناسبًا. تذكر أنه يجب وصف الأرقام بشكل عام في قسم النتائج.

  • المخططات / الرسوم البيانية
    • رسم تخطيطي يوضح الخطة التجريبية الشاملة والخطوات الرئيسية المتضمنة
  • الأرقام
    • جل من PCR الأولي
    • هلام مع عينات RT-PCR
    • منحنيات ملزمة لمجموعة البيانات الخاصة بك
  • جداول أو نصوص فقط
    • بيانات ملزمة (ذروة الارتفاع وذروة التحول) لقسم المختبر بأكمله (أو الفصل بأكمله إذا كان متاحًا في الوقت المناسب)

مراجع

لا يُتوقع منك إجراء مسح شامل للأدبيات الأولية ذات الصلة لهذا التقرير الأول. ومع ذلك ، يجب أن تحتوي المقدمة (وربما المناقشة) على ثلاثة مراجع على الأقل.

تقييم

يمكن العثور على النموذج الوصفي الكامل لتقارير المختبر على مبادئ توجيهية لكتابة البحث الخاص بك. ترجيح الوحدة 1 كالتالي:

الجزءقيمة (٪)
عنوان2
الملخص5
مقدمة20
المواد والأساليب15
نتائج25
مناقشة20
مراجع3
كتابة10

5.3.1: الوحدة الأولى - التخصيص - تقرير معمل هندسة الحمض النووي الريبي - علم الأحياء

ينقسم العمل المخبري إلى ثلاث وحدات من ثماني جلسات لكل منها. تتضمن المواد التعليمية لكل جلسة معملية (مرتبطة أدناه ضمن "مواد المختبر") مقدمة ، وبروتوكولًا تجريبيًا ، وقائمة كواشف ، متبوعة بـ & quot في المرة القادمة & quot ؛ مهمة منزلية. محاضرة قصيرة قبل المعمل تسبق معظم الجلسات المعملية.

يتم تضمين النتائج المختارة من بعض المعامل بإذن من الطلاب ويتم استخدامها بعد الحصول على إذن.


الملخص

للتغلب على المشاكل البيئية الناجمة عن استخدام الموارد الأحفورية ، أصبحت مصانع الخلايا الميكروبية تقنية واعدة للتطوير المستدام والصديق للبيئة للمنتجات القيمة من الموارد المتجددة. يتطلب بناء مصانع الخلايا الميكروبية ذات التتر العالي والإنتاجية والإنتاجية توازنًا بين النمو والإنتاج لتحقيق هذه الغاية ، وضبط التعبير الجيني والتنظيم ضروري لتحسين التدفقات الأيضية المعقدة والتحكم فيها بدقة. في هذه المقالة ، نستعرض الاتجاهات والتطورات الحالية في ضبط التعبير الجيني والتنظيم والنظر في هندستها في كل مرحلة من المراحل الثلاث لتنظيم الجينات: الجينوم ، و mRNA ، والبروتين. على وجه الخصوص ، تتم مراجعة الأساليب التكنولوجية المستخدمة في مجموعة متنوعة من الأدوات القائمة على الهندسة الوراثية لبناء مصانع الخلايا الميكروبية ويتم تقديم التطبيقات التمثيلية لهذه الاستراتيجيات. أخيرًا ، تتم مناقشة آفاق استراتيجيات وأنظمة ضبط التعبير الجيني والتنظيم.


عمل يومي

بالإضافة إلى المهام المذكورة أعلاه سيكون هناك

  • الاختبارات المعملية اليومية (5٪ من الدرجة النهائية)
    • تهدف هذه إلى تحديث ذاكرتك حول التجربة التي تقوم بإجرائها. لن تكون صعبة ويجب أن تستغرق من 5 إلى 10 دقائق فقط في بداية المختبر.
    • ستقوم بتسجيل بياناتك على الصفحات البيضاء لدفتر ملاحظات مجلّد. سيتم جمع الصفحات الصفراء المكررة وتقييمها من قبل مساعدي التدريس.
    • سيتم تقييم أجهزة الكمبيوتر المحمولة وفقًا للمعايير الموضحة هنا.
    • ستختلف هذه بشكل كبير في المحتوى والنقاط / الترجيح المرتبط بها. سيعدك معظمهم بشكل مباشر للتقييمات الرئيسية (على سبيل المثال ، عمل مسودة شخصية لتقرير معمل) أو عمل معمل (على سبيل المثال ، إجراء عملية حسابية مسبقًا).
    • يمكن العثور على الواجبات المنزلية في قسم "للمرة القادمة" (FNT) لكل يوم معمل وكذلك في قائمة واحدة هنا.
    • يجب تقديم الواجبات كنسخ مطبوعة في بداية المختبر. يجب أيضًا تقديم واجبات قليلة مختارة في ممتاز من أجل تلقي ملاحظات من المعلمين الكتابيين ويتم تمييزها على هذا النحو.
    • يمكنك العمل مع شريكك في المختبر والأصدقاء ومساعدي التدريس في FNTs ولكنك ستسلم المهام الفردية ما لم ينص على خلاف ذلك.
    • كطالب في 20.109 ، من المتوقع أن تكون مشاركًا نشطًا في مجتمع علمي. زملاؤك الطلاب ، وهيئة التدريس ، وخاصة شريكك في المعمل هم جميع المتعاونين معك. إنهم يعتمدون عليك لنشر بياناتك في الوقت المناسب ، ولإسهاماتك الفريدة والمدروسة أثناء الفصل.
    • سيتم تخصيص ثلث درجة مشاركتك مباشرة من قبل هيئة التدريس ، والتي ستأخذ في الاعتبار: ما إذا كنت قد طرحت و / أو أجبت على الأسئلة أثناء المحاضرة ، وما إذا كنت قد انخرطت في فرص تحسين فهمك / تواصلك / وما إلى ذلك ، وما إذا كنت قد قمت بالترقية بيئة صفية مراعية وتعاونية.
    • لتحديد الثلثين الآخرين من درجة مشاركتك ، ستكتب قطعًا عاكسة موجزة عن بعض جوانب تجربتك 20.109 طوال الفصل الدراسي. سيتم سرد هذه المهام ضمن قسم FNT لذلك اليوم ، ولكن سيتم احتسابها بشكل منفصل عن الواجبات المنزلية الأخرى. يجب أن تكمل ما لا يقل عن 4 ولا تزيد عن 8 انعكاسات. تم ربط جدول تاريخ الاستحقاق والمزيد من الشرح لكل من الانعكاسات الإلزامية والاختيارية هنا.

    5. معالجة مشاكل كبيرة في الكيمياء الحيوية الفيزيائية للـ RNA

    5.1 الأساس البنيوي لتغليف جينوم فيروس مولوني مورين اللوكيميا

    يمكن لـ 100 nt توجيه عبوات RNA إلى جزيئات تشبه الفيروسات ، وإن كان ذلك بكفاءة منخفضة. لاكتساب نظرة ثاقبة على الأساس الجزيئي لتعبئة الجينوم في MMLV ، حدد D'Souza و Summers ، باستخدام NMR ، الهيكل ثلاثي الأبعاد للجزء الفرعي 101 nt RNA من موقع Ψ في مجمع مع مجال nucleocapsid من البروتينات الكمامة الهامة للتوسط في هذا التفاعل [107]. لمعالجة أكبر بنية معروفة من الرنا النووي الريبي ، كان على المؤلفين استخدام إستراتيجية وضع العلامات النظيرية الخاصة بالنيوكليوتيدات للتغلب على تداخل التحول الكيميائي الشامل [61]. هذه الطرق مماثلة لتلك الموصوفة في جعل NTPs المسمى في الأقسام 3.0-3.4 أعلاه. مع هذا النهج ، كانوا قادرين على التمييز بين النوكليوتيدات والتأثيرات النووية الزائدة النوكليوتيد (NOE) ، والحصول على معلومات المسافة القيمة لحساب بنية دقة معتدلة [61 ، 107]. عيب هذا النهج هو أنه يتطلب تحضير ثماني عينات مختلفة ذات علامات نظيرية وجمع عدة مجموعات بيانات NMR ثنائية وثلاثية الأبعاد ورباعية الأبعاد ، مما يجعلها كثيفة العمالة والأجهزة [61]. من المحتمل أن تساعد استخدامات بعض التقنيات التي تمت مناقشتها أعلاه في الحصول على هياكل عالية الدقة لهذا المركب المهم بيولوجيًا.


    20.109 (S12): الوحدة 1

    في هذه الوحدة سوف تحقق في اختيار RNA aptamer. قد تكون بالفعل على دراية بالكيانات البيولوجية التي ترتبط بجزيئات معينة ، مثل بروتينات الجسم المضاد أو مشتقاتها الببتيدية. يمكن أن تحتوي الأجزاء القصيرة من الحمض النووي الريبي أيضًا على هياكل عالية الترتيب تسمح لها بربط الجزيء المستهدف بتقارب جيد وخصوصية جيدة تسمى الروابط الناجحة aptamers. عادة ، يتم العثور على أبتامرات الحمض النووي الريبي التي تربط أهدافًا معينة عن طريق فحص العديد من المرشحين بشكل عشوائي في عملية تسمى SELEX ، أو التطور المنهجي للروابط عن طريق التخصيب الأسي. (يمكن أيضًا استخدام الأدوات الحسابية التنبؤية لتصميم aptamers بدلاً من اختياره.) في الأسابيع القادمة ، ستقوم بشكل أساسي بإجراء جولة واحدة من SELEX. نظرًا لأن SELEX تستغرق عادةً عدة جولات لعزل aptamers المرتبطة بالهدف ، فستبدأ بمزيج RNA معروف بدلاً من مكتبة عشوائية تمامًا. سيكون هدفك هو استكشاف المعلمات التجريبية التي تؤثر على إثراء aptamer RNA المرتبط بالهيم من خليط من RNA المرتبط بالهيم وغير الملزم.

    نشكر المدربة 20.109 Natalie Kuldell على المناقشات المفيدة والحصول على التمويل لتطوير الوحدة.


    شاهد الفيديو: الصف الثاني عشر المسار الأدبي العلوم الهندسة العكسية واكتشاف الحمض النووي DNA (يوليو 2022).


تعليقات:

  1. Fitzsimons

    برافو ، فكرتك أنها رائعة

  2. Morrissey

    يمكنك البحث عن رابط لموقع مع عدد كبير من المقالات حول الموضوع الذي يثير اهتمامك.

  3. Tura

    أنت ترتكب خطأ. دعونا نناقشها. اكتب لي في رئيس الوزراء ، سوف نتحدث.

  4. Uisdean

    أود أن أتحدث إليكم ، لدي ما أقوله في هذه المسألة.

  5. Stevan

    معلومات رائعة ومسلية للغاية



اكتب رسالة